Poduzetnik Željko Markota  uputio je ministru  pravosuđa Draženu Bošnjakoviću protestno pismo  u kojem traži da se hitno istražiti  i ispita postupanje Trgovačkog suda u Dubrovniku,  odnosno Predsjednika suda, a moguće i drugih osoba i djelatnika suda  vezano za  slučaj Otok znanja. U pismu kojeg je uputio ministru te svim medijima između ostalog stoji : 

-Prije par dana, u srijedu 29. lipnja, sam zaprimio e-mail poruku poslanu od gosp. Ivana Vuleše, predsjednika Mjesnog odbora Koločepa koja me je krajnje zabrinula i potaknula na razmišljanje da sudovi u Republici Hrvatskoj ne samo da sude već sami i iniciraju postupke savjetuju jednu od stranaka, pozivaju jednu od stranaka na privatne razgovore kod Predsjednika suda i sami predlažu rješenja sporova.

Markota u pismu kaže kako je u vezi dosadašnjih i budućih postupanja Trgovačkog suda u Dubrovniku, opravdan njegov strah te pita ministra da mu odgovori  u kojim to slučajevima predsjednik trgovačkog suda samoinicijativno poziva na privatne sastanke jednu od eventualnih budućih stranaka u sporu,  u kojim to zakonom propisanim slučajevima Trgovački sud ima ovlasti sam inicirati postupak ili savjetovati stranku o postupanju s postupcima u tijeku ili onima koji slijede, te  može li  predsjednik suda komentirati pravnu strategiju ili odnose jedne od stranaka u sporu? Od minsistra Bošnjakovića Markota traži da najozbiljnije istraži  i najhitnije zatražite sudsku kontrolu postupanja Trgovačkog suda u Dubrovniku, kontrolu spisa u predmetima ustanove Otok znanja, Markot.tel d.o.o. i Hoteli Koločep d.d., te zatraži izviješće kojih sve djelatnika Trgovačkog  suda, na čiji poziv i kojim povodom je primljena očigledna delegacija predvođena gospodinom Vulešom dana 29.06.2011. godine.

Glasnogovornik Stalne službe Trgovačkog suda u Dubrovniku Srđan Gavranić kojeg smo zamolili za komentar  Markotinih navoda nam je kazao:

-Navode iz pisma koje nisam vidio ne mogu i ne smijem komentirati. Mogu samo kazati da je u pogledu ustanove Otok znanja  s Koločepa stečajni postupak otvoren i da je u tom postupku  od tvrtke Markotel d.o.o. iz Zagreba zatražena delegacija suda o kojoj je odlučeno. Također mogu reći  da je tvrtka Markotel zatražila izuzeće suca koji je po zahtjevu i spisu, upućen predsjedništvu suda u Splitu .Točno je da nam je od Ministarstva dostavljena predstavka gospodina Markote po kojoj je Ministarstvu upućeno očitovanje-kazao je Gavranić.